念珠藻沒有核仁,它屬於原核生物,沒有核膜核仁,也沒有染色質。這種植物是多細胞的絲狀體,膠紙鞘內包裹著單一或多數藻絲,藻絲為單列,細胞為球形、橢圓形、圓柱形等,從基部到頂部會逐漸變細。整體比較平直,也會彎曲旋繞,本身沒有分枝。